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封面投標報價文件項目名稱：組織樣本的真核轉(zhuǎn)錄組測序等服務(wù)（第二次）項目編號：BSRMYY-YNCG-2025-02003采購人（名稱）：投標人（蓋章）：投標人地址：聯(lián)系人：聯(lián)系電話：投標時間：采購需求介紹一、采購項目介紹序號名稱數(shù)量單位限價1提取+真核有參轉(zhuǎn)錄組建庫+6G測序+標準分析48個500元/個2組織解離+高通量10X單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（免疫組庫+5’端測序）建庫+10G/100G測序+標準分析3個9000元/個合計：51000元二、技術(shù)要求（須完全響應(yīng)）1轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)：①RNA提?。盒鑁iagenRNeasyMiniKit（catalog#74104）操作步驟進行提取。②cDNA擴增及建庫：按照RNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒InvitrogenSuperScriptIII、cDNA文庫制備試劑盒IlluminaTruSeqStrandedTotalRNASamplePrepKit（catalog#RS-122-2201）的操作說明書進行擴增及建庫。③測序平臺：本研究所涉及的IlluminaMiSeq平臺高通量測序。④數(shù)據(jù)質(zhì)控：為確保Reads有足夠高的質(zhì)量，將下機原始測序數(shù)據(jù)（rawreads）去掉含有帶接頭的、低質(zhì)量的reads，得到cleanreads，保證后續(xù)分析的準確性。⑤參考序列比對：將CleanReads與參考基因組進行序列比對，獲取在參考基因組或基因上的位置信息，定位區(qū)域分為Exon（外顯子）、Intron（內(nèi)含子）和Intergenic（基因間區(qū)）。⑥差異表達基因分析：差異表達基因以火山圖、MA圖、韋恩圖、聚類熱圖、蛋白互作圖等形式呈現(xiàn)，篩選差異基因標準一般為：FoldChange≥2，F(xiàn)DR<001。⑦差異表達基因GO分類：差異表達基因GO注釋分類統(tǒng)計圖，直觀的反映出在生物過程（biologicalprocess）、細胞組分（cellularcomponent）和分子功能（molecularfunction），所有基因和差異基因注釋GOterm的個數(shù)分布。⑧差異表達基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)：STRING收錄多個物種預(yù)測的和實驗驗證的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互作的數(shù)據(jù)庫，包括直接的物理互作和間接的功能相關(guān)。⑨差異表達基因KEGG通路富集：差異表達基因的KEGGPathway富集分析，系統(tǒng)分析基因產(chǎn)物在細胞中的代謝途徑以及這些基因產(chǎn)物功能，把基因及表達信息作為一個整體的網(wǎng)絡(luò)進行研究。2單細胞轉(zhuǎn)錄組+VDJ測序(10X平臺)：①組織解離成細胞懸液；②活細胞的總量、活性及濃度質(zhì)檢;③10X微流控上機，制備cDNA懸濁液；④對cDNA進行建庫，測序以及后續(xù)生信分析。⑤數(shù)據(jù)質(zhì)控：為確保Reads有足夠高的質(zhì)量，將下機原始測序數(shù)據(jù)（rawreads）去掉含有帶接頭的、低質(zhì)量的reads，得到cleanreads，保證后續(xù)分析的準確性。⑥細胞亞群分析：質(zhì)量控制、聚類分析、差異基因分析、差異基因GO富集分析、差異基因KEGG富集分析、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析、差異基因轉(zhuǎn)錄因子注釋、Reactome通路富集分析、GSVA分析、差異基因疾病注釋功能分析、細胞亞群細胞通訊分析和細胞亞群鑒定。三、商務(wù)需求：（須完全響應(yīng)）1供應(yīng)商基本資格條件一般資質(zhì)條件1具有獨立承擔民事責任的能力；如公司營業(yè)執(zhí)照（須圈出符合資質(zhì)要求的經(jīng)營范圍和有效期）；2具有良好的商業(yè)信譽和健全的財務(wù)會計制度（提供承諾函）；3具有履行合同所必需的設(shè)備和專業(yè)技術(shù)能力（提供承諾函）；4有依法繳納稅收和社會保障資金的良好記錄（提供承諾函）；5參加政府采購活動前三年內(nèi)，在經(jīng)營活動中沒有重大違法記錄（提供承諾函）；6法律、行政法規(guī)規(guī)定的其他條件。特定資格條件：1需具有細胞、載體表達、信號轉(zhuǎn)導、表觀遺傳、病理（動物實驗）、高通量測序、生物信息學分析等專業(yè)平臺（請?zhí)峁┳糇C材料并標注所在頁碼）；2提供2份類似項目的合同及發(fā)票；3項目使用設(shè)備相關(guān)合格證、配套試劑注冊或備案證、人員操作資質(zhì)、實驗室資質(zhì)等資料；4其他包括但不限于國家現(xiàn)行或更新的法律法規(guī)要求必須具備的資格，供應(yīng)商不能滿足特定資格條件要求的不能參與投標。2項目最高限價本項目最高限價51000元。報價要求：本次報價為人民幣包干價，包含：檢測服務(wù)費、標本運輸保存銷毀、資料裝訂及郵寄費、稅費、保險費、驗收檢測費等完成本項目所需的一切費用。因成交供應(yīng)商自身原因造成漏報、少報皆由其自行承擔責任，采購人不再補償。3服務(wù)期及合同簽訂成交供應(yīng)商在接到成交通知后20日內(nèi)與采購人簽訂采購合同和廉政購銷協(xié)議。本項目要求供應(yīng)商自中選后起20個工作日完成檢測。4付款方式合同簽訂生效后一次性支付50%，驗收結(jié)算后支付剩余50%，付款時供應(yīng)商須提交全額發(fā)票、驗收記錄。合作期間項目數(shù)量有增減，按供應(yīng)商分項報價據(jù)實結(jié)算。5驗收方案（1）根據(jù)詢價文件要求（包括完成時限、完成內(nèi)容、完成質(zhì)量）的項目逐項驗收；（2）驗收產(chǎn)生爭議時由采購人擇優(yōu)選擇第三方有資質(zhì)的機構(gòu)進行檢測，驗收費用由供應(yīng)商承擔。6配套服務(wù)（1）提供其他科研咨詢服務(wù)。（2）服務(wù)期間定期溝通反饋項目進度。（3）供應(yīng)商應(yīng)隨時解答標本檢測數(shù)據(jù)的相關(guān)咨詢及質(zhì)疑。（4）項目完成后標本返回采購方或征得同意后銷毀，供應(yīng)商需為采購人的原始數(shù)據(jù)、實驗設(shè)計及分析結(jié)果保密，且需簽署保密協(xié)議，未經(jīng)采購人同意，供應(yīng)商不得對任何第三方公布上述信息。7踏勘現(xiàn)場采購人不組織現(xiàn)場踏勘，供應(yīng)商自行現(xiàn)場踏勘充分了解項目位置、運行情況、周邊環(huán)境、裝卸限制及任何其他足以影響磋商報價的情況，任何因忽視或誤解項目情況而導致的服務(wù)不達標或服務(wù)期延長的，供應(yīng)商自行承擔相關(guān)責任。踏勘現(xiàn)場時發(fā)生的安全責任事故和相關(guān)費用由供應(yīng)商自行承擔責任，項目實施時不得影響周邊居民的正常生活。8違約責任中標供應(yīng)商未在約定期限交付檢測報告，每延遲一日支付總金額千分之三的違約金，超過30日未能交付，采購人有權(quán)解除合同；按照驗收不合格，采購人有權(quán)要求供應(yīng)商整改，