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[省本級(jí)]江西國政招標(biāo)咨詢有限公司關(guān)于江西省江西農(nóng)業(yè)大學(xué)生物樣本三代基因組等測序服務(wù)項(xiàng)目(采購編號(hào):JXGZ2025-11-1302)電子化政府采購競爭性磋商采購公告-采購公告服務(wù)需求.pdf

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東湖區(qū) 2025-12-10 66.6KB 業(yè)主:江西農(nóng)業(yè)大學(xué)
內(nèi)容簡介

(一)采購需求表采購條目編號(hào)采購條目名稱數(shù)量單位預(yù)算單價(jià)(元)預(yù)算總價(jià)(元)贛購2025B000176439生物樣本三代基因組測序12個(gè)1100000元13200000元贛購2025B000176440生物樣本全長轉(zhuǎn)錄組測序48個(gè)650000元31200000元贛購2025B000176441生物樣本全轉(zhuǎn)錄組測序124個(gè)260000元32240000元注:磋商響應(yīng)報(bào)價(jià)時(shí)不允許超過單價(jià)最高限價(jià),否則視為無效響應(yīng)。(二)服務(wù)需求序號(hào)項(xiàng)目名稱技術(shù)要求1生物樣本三代基因組測序本項(xiàng)包含組織樣本DNA抽提、質(zhì)檢、HiFi建庫測序。1、提取建庫11針對提供樣本進(jìn)行DNA提取,并提供檢測報(bào)告。達(dá)到Qubit總量m≥5ug,Qubit濃度≥70ng/ul,主帶30k以上,無污染、無雜質(zhì)、無沉淀、顏色透明。12構(gòu)建HiFi文庫,文庫質(zhì)量良好,均一性高。2、數(shù)據(jù)產(chǎn)出21測序平臺(tái):要求使用PacBioRevio,已公開公布擁有相關(guān)的測序平臺(tái)。22使用標(biāo)準(zhǔn)流程進(jìn)行測序,HiFi測序每個(gè)樣本上機(jī)一個(gè)cell,承諾單cell產(chǎn)出≥90GHiFidata,N50是15k~18k,質(zhì)量值中位數(shù)≥Q30;23產(chǎn)生合格樣品測序多測出的數(shù)據(jù)為采購人無償所有,產(chǎn)出數(shù)據(jù)量不夠或者質(zhì)量不達(dá)標(biāo)的樣品,服務(wù)商需要免費(fèi)補(bǔ)測。3、結(jié)果交付31周期:HiFi測序樣本檢測合格后20個(gè)自然日內(nèi)交付測序結(jié)果;32交付形式:結(jié)題報(bào)告(含質(zhì)檢報(bào)告)、HiFidata等。33供應(yīng)商需具備大數(shù)據(jù)交付能力。4、供應(yīng)商需為本項(xiàng)目擬派一名項(xiàng)目負(fù)責(zé)人及至少6名項(xiàng)目組成員進(jìn)行服務(wù)。2生物樣本全長轉(zhuǎn)錄組測序本項(xiàng)包含組織樣本RNA抽提、質(zhì)檢、Kinnex全長轉(zhuǎn)錄組建庫、測序,承諾單cell產(chǎn)出≥40MHiFireads,3個(gè)樣本混一個(gè)cell承諾單樣本產(chǎn)出不低于10MHiFireads;1、提取建庫11針對提供樣本進(jìn)行RNA提取,并提供檢測報(bào)告。達(dá)到Qubit總量m≥06ug,Qubit濃度≥40ng/ul,RIN≥65,無污染、無雜質(zhì)、無沉淀、顏色透明。12構(gòu)建Kinnex全長轉(zhuǎn)錄組文庫,文庫質(zhì)量良好,均一性高,每3個(gè)樣本混一個(gè)cell上機(jī)測序。2、數(shù)據(jù)產(chǎn)出21測序平臺(tái):要求使用PacBioRevio平臺(tái),已公開公布擁有相關(guān)的測序平臺(tái)。22使用標(biāo)準(zhǔn)流程進(jìn)行測序,承諾單cell產(chǎn)出≥40MHiFireads,3個(gè)樣本混一個(gè)cell承諾單樣本產(chǎn)出不低于10MHiFireads。數(shù)據(jù)Qv≥29,readsN50≥15k,平均長度≥14k,F(xiàn)SM+ISM+NIC+NNC的占比≥80%。23產(chǎn)生合格樣品測序多測出的數(shù)據(jù)為采購人無償所有,產(chǎn)出數(shù)據(jù)量不夠或者質(zhì)量不達(dá)標(biāo)的樣品,服務(wù)商需要免費(fèi)補(bǔ)測。3、結(jié)果交付31周期:Kinnex全長轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)樣本檢測合格后25個(gè)自然日內(nèi)交付測序結(jié)果;32交付形式:結(jié)題報(bào)告(含質(zhì)檢報(bào)告)、HiFidata等。33供應(yīng)商需具備大數(shù)據(jù)交付能力。4、供應(yīng)商需為本項(xiàng)目擬派一名項(xiàng)目負(fù)責(zé)人及至少6名項(xiàng)目組成員進(jìn)行服務(wù)。3生物樣本全轉(zhuǎn)錄組測序本項(xiàng)包含組織樣本RNA抽提、質(zhì)檢、構(gòu)建全轉(zhuǎn)錄組文庫,包括lncRNA建庫測序,smallRNA建庫測序,circRNA建庫測序。1、提取與建庫11針對提供樣本進(jìn)行RNA提取,并提供檢測報(bào)告。針對不同的文庫類型,對應(yīng)的RNA質(zhì)量要求不同,要求:lncRNA文庫:m≥500ng;RIN值≥55;無污染、無雜質(zhì)、無沉淀、顏色透明;smallRNA文庫:m≥2ug;RIN值≥75;污染、無雜質(zhì)、無沉淀、顏色透明;circRNA文庫:m≥2ug;RIN值≥7;污染、無雜質(zhì)、無沉淀、顏色透明;12分別構(gòu)建lncRNA文庫,smallRNA文庫,circRNA文庫,文庫質(zhì)量良好。2、數(shù)據(jù)產(chǎn)出21測序平臺(tái):要求使用illumina平臺(tái),已公開公布擁有相關(guān)的測序平臺(tái)。22使用標(biāo)準(zhǔn)流程進(jìn)行測序,lncRNA文庫產(chǎn)出≥30Grawdata,smallRNA文庫產(chǎn)出≥50Mrawreads,cirRNA文庫產(chǎn)出≥15Grawdata。數(shù)據(jù)要求:Q20≥85%,Q30≥90%,rRNA含量≤15%。23產(chǎn)生合格樣品測序多測出的數(shù)據(jù)為采購人無償所有,產(chǎn)出數(shù)據(jù)量不夠或者質(zhì)量不達(dá)標(biāo)的樣品,服務(wù)商需要免費(fèi)補(bǔ)測。3、結(jié)果交付31周期:測序樣本檢測合格后26個(gè)自然日內(nèi)交付測序結(jié)果;32交付形式:結(jié)題報(bào)告(含質(zhì)檢報(bào)告)、HiFidata等。33供應(yīng)商需具備大數(shù)據(jù)交付能力。4、供應(yīng)商需為本項(xiàng)目擬派一名項(xiàng)目負(fù)責(zé)人及至少6名項(xiàng)目組成員進(jìn)行服務(wù)。供應(yīng)商需為本項(xiàng)目擬派一名項(xiàng)目負(fù)責(zé)人及至少6名項(xiàng)目組成員進(jìn)行服務(wù)。注:以上服務(wù)需求內(nèi)容及要求各項(xiàng)內(nèi)容必須滿足或優(yōu)于,否則視為無效響應(yīng)。