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采購需求一、服務要求及參數(shù)1樣本接收實驗室具有ISO9001質量管理體系證書和生物安全II級（BSL-2）資質，可以處理生物安全法規(guī)允許的相應病原體，提供相關佐證材料；2實驗室搭載二代測序或三代測序的技術平臺，包括DNBSEQ、PacBio、Nonapore或ABI3730xl、NextSeq、MiSeq等；3病原體測序的報告周期：細菌基因組組裝50樣本以內在15工作日內完成，包括分析。4專用核酸提取試劑可搭配儀器使用，對革蘭氏陽性菌、革蘭氏陰性菌均有較好效果，提高低濃度樣本的文庫構建和測序成功概率（說明書中有特別標注用于測序，提供生產(chǎn)商蓋章說明書）；可免費提供提取設備及專用試劑供用戶自測驗證；5對病原體核酸檢測、文庫構建、測序以及數(shù)據(jù)分析整個流程提供打包服務；6最終反饋的測序數(shù)據(jù)質量情況：Q30>85%，CleanData>1G；7最終數(shù)據(jù)的組裝結果滿足：基因組覆蓋度>99%,平均測序覆蓋深度>100x，scaffold不超過100個；8最終提供的測序數(shù)據(jù)文件無需額外分析處理，可以直接上傳國家致病菌識別網(wǎng)實驗室監(jiān)測信息的系統(tǒng)；9提供生物信息分析服務，基因組組裝、基因組組分分析、基因功能分析、動物病原細菌致病性和耐藥性分析等，包括：病原與宿主互作數(shù)據(jù)庫（PHI）注釋、細菌致病菌毒力因子（VFDB）注釋、耐藥基因（CARD）注釋等分析服務。依據(jù)客戶需求提供個性化分析服務，提供論文插圖、翻譯、寫作、投稿等協(xié)助服務。10有過細菌基因組項目經(jīng)驗，擁有專業(yè)測序分析團隊，相關人員有多年從事病原體測序工作經(jīng)驗；11宏基因測序要求：111Rawdata要求：1111雙端測序，reads長度至少150bp,1112Rawdata數(shù)據(jù)量：至少10G；1113rawdata質量：Q30以上占比高于85%，Q20以上高于90%。112Rawdata過濾原則：去接頭序列，去宿主序列，刪除與接頭序列有15bp重合的reads113cleandata過濾原則：含5bpN的reads丟棄，截掉平均質量低于20的序列12在核酸質控合格的情況下，如果測序不成功或數(shù)據(jù)質量不符合雙方約定的標準，發(fā)生測序結果上傳國家數(shù)據(jù)庫不合格的情況，僅收取質檢相關費用，不收取測序費用。13本次測序標本包括國家致病菌識別網(wǎng)細菌基因組框架圖測定分析服務160株（600元/株）、細菌全基因組完成圖測序分析服務20株（3000元/株）、病原體宏基因測序90份（1000元/份），具體測序方式及數(shù)量以實際需求為準，總價246萬元，測序數(shù)據(jù)及服務需通過使用單位質量復核后方為驗收合格。14為了確保投標人能夠按時順利完成該項目，要求投標人提供的實驗室擁有三臺以上測序平臺,并標明以上設備的序列號，以及現(xiàn)場圖片。15投標人需提供兩家以上的測序公司平臺，以保證病原菌測序質量的可比性。備注說明：1我們的樣本主要是病原微生物，有致病性的特點，為保證生物安全的要求，實驗室必須具有ISO9001質量管理體系證書和生物安全II級（BSL-2）資質，可以處理相應病原體。2除測序外，提供專業(yè)的信息學分析結果，以便快速了解疫情，分析病原；提供內存一個8TB移動硬盤儲存原始數(shù)據(jù)。3根據(jù)實際工作需要，具體測序服務種類和數(shù)量可能會有所調整，供應商須能夠滿足采購人調整需求。二、采購商務要求1報價要求：供應商的報價應包括：人員費用、運輸費用、設備費、管理費及稅金等為完成競價文件規(guī)定全部內容所需的一切應有費用。2交貨地點：采購人指定地點。3付款及結算方式：驗收合格后，成交供應商按采購人要求憑國家正式發(fā)票及相關證明文件向采購人申請付款，采購人收到申請后在15個工作日內結清全部貨款。4踏勘現(xiàn)場：本項目采購人不組織集中踏勘現(xiàn)場。5驗收方法及標準：按照簽訂的采購合同、技術要求及標準對每一環(huán)節(jié)、標準的履約情況進行驗收。驗收結束后，應當出具驗收書，由雙方共同簽署。