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采購(gòu)需求一、服務(wù)要求及參數(shù)1樣本接收實(shí)驗(yàn)室具有ISO9001質(zhì)量管理體系證書(shū)和生物安全I(xiàn)I級(jí)（BSL-2）資質(zhì)，可以處理生物安全法規(guī)允許的相應(yīng)病原體，提供相關(guān)佐證材料；2實(shí)驗(yàn)室搭載二代測(cè)序或三代測(cè)序的技術(shù)平臺(tái)，包括DNBSEQ、PacBio、Nonapore或ABI3730xl、NextSeq、MiSeq等；3病原體測(cè)序的報(bào)告周期：細(xì)菌基因組組裝50樣本以?xún)?nèi)在15工作日內(nèi)完成，包括分析。4專(zhuān)用核酸提取試劑可搭配儀器使用，對(duì)革蘭氏陽(yáng)性菌、革蘭氏陰性菌均有較好效果，提高低濃度樣本的文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序成功概率（說(shuō)明書(shū)中有特別標(biāo)注用于測(cè)序，提供生產(chǎn)商蓋章說(shuō)明書(shū)）；可免費(fèi)提供提取設(shè)備及專(zhuān)用試劑供用戶(hù)自測(cè)驗(yàn)證；5對(duì)病原體核酸檢測(cè)、文庫(kù)構(gòu)建、測(cè)序以及數(shù)據(jù)分析整個(gè)流程提供打包服務(wù)；6最終反饋的測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量情況：Q30>85%，CleanData>1G；7最終數(shù)據(jù)的組裝結(jié)果滿足：基因組覆蓋度>99%,平均測(cè)序覆蓋深度>100x，scaffold不超過(guò)100個(gè)；8最終提供的測(cè)序數(shù)據(jù)文件無(wú)需額外分析處理，可以直接上傳國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)信息的系統(tǒng)；9提供生物信息分析服務(wù)，基因組組裝、基因組組分分析、基因功能分析、動(dòng)物病原細(xì)菌致病性和耐藥性分析等，包括：病原與宿主互作數(shù)據(jù)庫(kù)（PHI）注釋、細(xì)菌致病菌毒力因子（VFDB）注釋、耐藥基因（CARD）注釋等分析服務(wù)。依據(jù)客戶(hù)需求提供個(gè)性化分析服務(wù)，提供論文插圖、翻譯、寫(xiě)作、投稿等協(xié)助服務(wù)。10有過(guò)細(xì)菌基因組項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)，擁有專(zhuān)業(yè)測(cè)序分析團(tuán)隊(duì)，相關(guān)人員有多年從事病原體測(cè)序工作經(jīng)驗(yàn)；11宏基因測(cè)序要求：111Rawdata要求：1111雙端測(cè)序，reads長(zhǎng)度至少150bp,1112Rawdata數(shù)據(jù)量：至少10G；1113rawdata質(zhì)量：Q30以上占比高于85%，Q20以上高于90%。112Rawdata過(guò)濾原則：去接頭序列，去宿主序列，刪除與接頭序列有15bp重合的reads113cleandata過(guò)濾原則：含5bpN的reads丟棄，截掉平均質(zhì)量低于20的序列12在核酸質(zhì)控合格的情況下，如果測(cè)序不成功或數(shù)據(jù)質(zhì)量不符合雙方約定的標(biāo)準(zhǔn)，發(fā)生測(cè)序結(jié)果上傳國(guó)家數(shù)據(jù)庫(kù)不合格的情況，僅收取質(zhì)檢相關(guān)費(fèi)用，不收取測(cè)序費(fèi)用。13本次測(cè)序標(biāo)本包括國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)細(xì)菌基因組框架圖測(cè)定分析服務(wù)160株（600元/株）、細(xì)菌全基因組完成圖測(cè)序分析服務(wù)20株（3000元/株）、病原體宏基因測(cè)序90份（1000元/份），具體測(cè)序方式及數(shù)量以實(shí)際需求為準(zhǔn)，總價(jià)246萬(wàn)元，測(cè)序數(shù)據(jù)及服務(wù)需通過(guò)使用單位質(zhì)量復(fù)核后方為驗(yàn)收合格。14為了確保投標(biāo)人能夠按時(shí)順利完成該項(xiàng)目，要求投標(biāo)人提供的實(shí)驗(yàn)室擁有三臺(tái)以上測(cè)序平臺(tái),并標(biāo)明以上設(shè)備的序列號(hào)，以及現(xiàn)場(chǎng)圖片。15投標(biāo)人需提供兩家以上的測(cè)序公司平臺(tái)，以保證病原菌測(cè)序質(zhì)量的可比性。備注說(shuō)明：1我們的樣本主要是病原微生物，有致病性的特點(diǎn)，為保證生物安全的要求，實(shí)驗(yàn)室必須具有ISO9001質(zhì)量管理體系證書(shū)和生物安全I(xiàn)I級(jí)（BSL-2）資質(zhì)，可以處理相應(yīng)病原體。2除測(cè)序外，提供專(zhuān)業(yè)的信息學(xué)分析結(jié)果，以便快速了解疫情，分析病原；提供內(nèi)存一個(gè)8TB移動(dòng)硬盤(pán)儲(chǔ)存原始數(shù)據(jù)。3根據(jù)實(shí)際工作需要，具體測(cè)序服務(wù)種類(lèi)和數(shù)量可能會(huì)有所調(diào)整，供應(yīng)商須能夠滿足采購(gòu)人調(diào)整需求。二、采購(gòu)商務(wù)要求1報(bào)價(jià)要求：供應(yīng)商的報(bào)價(jià)應(yīng)包括：人員費(fèi)用、運(yùn)輸費(fèi)用、設(shè)備費(fèi)、管理費(fèi)及稅金等為完成競(jìng)價(jià)文件規(guī)定全部?jī)?nèi)容所需的一切應(yīng)有費(fèi)用。2交貨地點(diǎn)：采購(gòu)人指定地點(diǎn)。3付款及結(jié)算方式：驗(yàn)收合格后，成交供應(yīng)商按采購(gòu)人要求憑國(guó)家正式發(fā)票及相關(guān)證明文件向采購(gòu)人申請(qǐng)付款，采購(gòu)人收到申請(qǐng)后在15個(gè)工作日內(nèi)結(jié)清全部貨款。4踏勘現(xiàn)場(chǎng)：本項(xiàng)目采購(gòu)人不組織集中踏勘現(xiàn)場(chǎng)。5驗(yàn)收方法及標(biāo)準(zhǔn)：按照簽訂的采購(gòu)合同、技術(shù)要求及標(biāo)準(zhǔn)對(duì)每一環(huán)節(jié)、標(biāo)準(zhǔn)的履約情況進(jìn)行驗(yàn)收。驗(yàn)收結(jié)束后，應(yīng)當(dāng)出具驗(yàn)收書(shū)，由雙方共同簽署。