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新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團疾病預(yù)防控制中心2025年病毒基因測序及分析服務(wù)文件.docx

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頭屯河區(qū) 2025-10-29 14.93KB 業(yè)主：新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團疾病預(yù)防控制中心
內(nèi)容簡介

測序+組裝+標準分析要求信息分析條款信息分析內(nèi)容組裝1原始數(shù)據(jù)進行去除接頭和低質(zhì)量read的處理2數(shù)據(jù)產(chǎn)出以及數(shù)據(jù)質(zhì)控(基于第1條)3組裝，質(zhì)控統(tǒng)計(GC-depth分析)、非一致序列(k-mer分析)、NT庫比對(存在非一致序列)基因組組分分析基因成分分析重復(fù)序列非編碼RNA基因功能分析基因功能注釋(Swiss-port,KEGG,COG,CAZy,CARD,VFDB,T3SS)平臺要求DNBSEQ+Cyclone（三代平臺）測序長度10-15Kb文庫，1cell；200-300bp文庫，1G測序數(shù)據(jù)數(shù)量要求450引物合成按提供序列合成引物樣本要求采集樣本提取后開始進行測序

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