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封面投標(biāo)報(bào)價(jià)文件項(xiàng)目名稱：細(xì)胞樣本的10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組+VDJ測序及真核有參轉(zhuǎn)錄組測序等服務(wù)項(xiàng)目編號(hào)：BSRMYY-YNCG-2025-06006采購人（名稱）：重慶市璧山區(qū)人民醫(yī)院投標(biāo)人（蓋章）：投標(biāo)人地址：聯(lián)系人：聯(lián)系電話：投標(biāo)時(shí)間：采購需求介紹一、采購項(xiàng)目介紹序號(hào)項(xiàng)目名稱樣本數(shù)量（個(gè)）單價(jià)限價(jià)（元）總價(jià)（元）1組織解離+高通量10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（TCR+BCR+5’端測序）建庫+100G+10G測序+標(biāo)準(zhǔn)分析39000570002核酸提取+真核有參轉(zhuǎn)錄組建庫(PolyA)+6G測序+標(biāo)準(zhǔn)分析75400注：采購項(xiàng)目總價(jià)最高限價(jià)57000元，包括但不限于項(xiàng)目服務(wù)費(fèi)、配套設(shè)備輔材費(fèi)、標(biāo)本運(yùn)輸保存銷毀、資料裝訂及郵寄費(fèi)、稅費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)、保密費(fèi)、驗(yàn)收檢測費(fèi)等完成本項(xiàng)目所需的一切費(fèi)用。因成交供應(yīng)商自身原因造成漏報(bào)、少報(bào)皆由其自行承擔(dān)責(zé)任，采購人不再補(bǔ)償。二、技術(shù)要求（需全部滿足）序號(hào)名稱服務(wù)內(nèi)容1組織解離+高通量10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（TCR+BCR+5’端測序）建庫+100G+10G測序+標(biāo)準(zhǔn)分析單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組+VDJ測序(10X平臺(tái))：①組織解離成細(xì)胞懸液；②活細(xì)胞的總量、活性及濃度質(zhì)檢；③10X微流控上機(jī)，制備cDNA懸濁液；④對cDNA進(jìn)行建庫，采用測序平臺(tái)IlluminaPE150測序以及后續(xù)生信分析。⑤數(shù)據(jù)質(zhì)控：為確保Reads有足夠高的質(zhì)量，將下機(jī)原始測序數(shù)據(jù)（rawreads）去掉含有帶接頭的、低質(zhì)量的reads，得到cleanreads，保證后續(xù)分析的準(zhǔn)確性。⑥細(xì)胞亞群分析：質(zhì)量控制、聚類分析、差異基因分析、差異基因GO富集分析、差異基因KEGG富集分析、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析、差異基因轉(zhuǎn)錄因子注釋、Reactome通路富集分析、GSVA分析、差異基因疾病注釋功能分析、細(xì)胞亞群細(xì)胞通訊分析和細(xì)胞亞群鑒定。交付：原始數(shù)據(jù)和所有分析結(jié)果。核酸提取+真核有參轉(zhuǎn)錄組建庫(PolyA)+6G測序+轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)：①RNA提?。盒鑁iagenRNeasyMiniKit（catalog#74104）操作步驟標(biāo)準(zhǔn)分析進(jìn)行提取。②cDNA擴(kuò)增及建庫：按照RNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒InvitrogenSuperScriptIII、cDNA文庫制備試劑盒IlluminaTruSeqStrandedTotalRNASamplePrepKit（catalog#RS-122-2201）的操作說明書進(jìn)行擴(kuò)增及建庫。③測序：采用IlluminaMiSeq平臺(tái)進(jìn)行高通量測序。④數(shù)據(jù)質(zhì)控：為確保Reads有足夠高的質(zhì)量，將下機(jī)原始測序數(shù)據(jù)（rawreads）去掉含有帶接頭的、低質(zhì)量的reads，得到cleanreads，保證后續(xù)分析的準(zhǔn)確性。⑤參考序列比對：將CleanReads與參考基因組進(jìn)行序列比對，獲取在參考基因組或基因上的位置信息，定位區(qū)域分為Exon（外顯子）、Intron（內(nèi)含子）和Intergenic（基因間區(qū)）。⑥差異表達(dá)基因分析：差異表達(dá)基因以火山圖、MA圖、韋恩圖、聚類熱圖、蛋白互作圖等形式呈現(xiàn)，篩選差異基因標(biāo)準(zhǔn)一般為：FoldChange≥2，F(xiàn)DR<001。⑦差異表達(dá)基因GO分類：差異表達(dá)基因GO注釋分類統(tǒng)計(jì)圖，直觀的反映出在生物過程（biologicalprocess）、細(xì)胞組分（cellularcomponent）和分子功能（molecularfunction），所有基因和差異基因注釋GOterm的個(gè)數(shù)分布。⑧差異表達(dá)基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析：將樣本測序數(shù)據(jù)與STRING（收錄多個(gè)物種預(yù)測的和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互作的數(shù)據(jù)庫）數(shù)據(jù)進(jìn)行對比分析，分析涵蓋直接的物理互作和間接的功能相關(guān)等。⑨差異表達(dá)基因KEGG通路富集分析：差異表達(dá)基因的KEGGPathway富集分析，系統(tǒng)分析基因產(chǎn)物在細(xì)胞中的代謝途徑以及這些基因產(chǎn)物功能，把基因及表達(dá)信息作為一個(gè)整體的網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行研究。交付：原始數(shù)據(jù)和所有分析結(jié)果。三、商務(wù)需求：（需全部滿足）（一）供應(yīng)商資格條件一般資質(zhì)條件1具有獨(dú)立承擔(dān)民事責(zé)任的能力；如公司營業(yè)執(zhí)照（須圈出符合資質(zhì)要求的經(jīng)營范圍和有效期）；2具有良好的商業(yè)信譽(yù)和健全的財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)制度（提供承諾函）；3具有履行合同所必需的設(shè)備和專業(yè)技術(shù)能力（提供承諾函）；4有依法繳納稅收和社會(huì)保障資金的良好記錄（提供承諾函）；5參加政府采購活動(dòng)前三年內(nèi)，在經(jīng)營活動(dòng)中沒有重大違法記錄（提供承諾函）；特定資格條件：1提供實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)、專業(yè)測序平臺(tái)證明、ISO9001體系認(rèn)證、ISO/IEC27001體系認(rèn)證、生物安全實(shí)驗(yàn)室備案證書、能力驗(yàn)證/室間質(zhì)評(píng)證書、實(shí)驗(yàn)室人員資質(zhì)證明、配套設(shè)備及試劑的合格證、注證冊或備案證；2提供具有履行合同所需的設(shè)備、試劑和專業(yè)技術(shù)能力聲明;3提供2024年至今2份類似項(xiàng)目的合同、發(fā)票、驗(yàn)收記錄；4其他法律法規(guī)有關(guān)規(guī)范。（二）報(bào)價(jià)要求本項(xiàng)目最高限價(jià)57000元。報(bào)價(jià)要求：包括但不限于項(xiàng)目服務(wù)費(fèi)、配套設(shè)備輔材費(fèi)、標(biāo)本運(yùn)輸保存銷毀、資料裝訂及郵寄費(fèi)、稅費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)、保密費(fèi)、驗(yàn)收檢測費(fèi)等完成本項(xiàng)目所需的一切費(fèi)用。因成交供應(yīng)商自身原因造成漏報(bào)、少報(bào)皆由其自行承擔(dān)責(zé)任，采購人不再補(bǔ)償。報(bào)送總價(jià)不得超過采購人要求，否則視為無效報(bào)價(jià)。（三）合同簽訂及服務(wù)期限成交供應(yīng)商在接到成交通知后20日內(nèi)與采購人簽訂采購合同和廉政購銷協(xié)議，供應(yīng)商應(yīng)指定銷售代表姓名及聯(lián)系方式，不得實(shí)施商業(yè)賄賂等不良行為。本項(xiàng)目要求：針對需供應(yīng)商提取核酸的樣本，5個(gè)工作日內(nèi)完成核酸提取和質(zhì)檢；不需供應(yīng)商提取核酸的樣本，2個(gè)工作日內(nèi)完成核酸質(zhì)檢。供應(yīng)商在收到符合實(shí)驗(yàn)要求的樣本及與采購人確認(rèn)核對后，12-15個(gè)工作日內(nèi)完成測序相關(guān)的全部工作，并向采購人交付分析結(jié)果及相應(yīng)報(bào)告。最長1年時(shí)間完成項(xiàng)目要求的所有服務(wù)內(nèi)容。（四）付款方式驗(yàn)收合格后，供應(yīng)商提供驗(yàn)收記錄、發(fā)票等資料，采購人全額支付。合作期間項(xiàng)目數(shù)量有減少，按供應(yīng)商分項(xiàng)報(bào)價(jià)據(jù)實(shí)結(jié)算。（五）驗(yàn)收方式按照采購招投標(biāo)文件要求（包括完成時(shí)限、完成內(nèi)容、完成質(zhì)量等）逐項(xiàng)驗(yàn)收，驗(yàn)收產(chǎn)生爭議由采購人擇優(yōu)選擇第三方有資質(zhì)的機(jī)構(gòu)檢測，費(fèi)用由供應(yīng)商承擔(dān)。