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云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所關(guān)于云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所采購技術(shù)測試和分析服務(wù)(第二批)二次的公開招標(biāo)公告采購需求.pdf

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盤龍區(qū) 2025-11-27 87.68KB 業(yè)主:云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所
內(nèi)容簡介

采購需求序號(hào)品目物品名稱規(guī)格數(shù)量單位單價(jià)(元)總價(jià)(元)技術(shù)參數(shù)/質(zhì)量要求1技術(shù)測試與分析宏基因組+MAG12G50個(gè)61630800實(shí)驗(yàn):測序產(chǎn)出有效數(shù)據(jù)量不低于12G/例樣品,堿基類型分布均勻且無分離現(xiàn)象,測序Q30≥90%。分析平臺(tái):同時(shí)具有宏基因組分析云平臺(tái)、MAG分析云平臺(tái)、宏基因組與代謝組聯(lián)合分析云平臺(tái)宏基因組分析內(nèi)容:NR物種注釋、KEGG功能注釋、VFDB功能注釋、CAZy功能注釋、probio益生菌注釋、QS群體注釋等基礎(chǔ)功能注釋分析、alpha多樣性分析、PCoA分析、群落結(jié)構(gòu)NST分析、物種與功能組成分析、物種與功能差異分析、menteltest分析、物種與功能貢獻(xiàn)度分析、WGCNA分析等內(nèi)容分箱策略:單樣本分箱分箱軟件:至少利用三款分箱軟件進(jìn)行binning組裝(MetaBAT、CONCOCT、Maxbin2等)MAG分析內(nèi)容:基因注釋(包括CAzy碳水化合物酶注釋、毒力基因注釋、可移動(dòng)元件注釋、bacmet抗性基因注釋等)、基因遺傳轉(zhuǎn)移分析、MAGs群落組成分析、MAGs表型相關(guān)性分析、MAGs群體進(jìn)化分析以及基因組比較分析等內(nèi)容宏基因組與代謝組聯(lián)合分析內(nèi)容:普氏分析、O2PLS分析、Manteltest分析、相關(guān)性熱圖分析、線性回歸分析、相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)圖分析、HCLUST分析、MaAsLin分析、WGCNA分析、隨機(jī)森林分析、mmvec分析、通路注釋分析等分析內(nèi)容2宏轉(zhuǎn)錄組6G60個(gè)62037200實(shí)驗(yàn):測序產(chǎn)出有效數(shù)據(jù)量不低于6G/例樣品,堿基類型分布均勻且無分離現(xiàn)象,測序Q30≥90%。分析平臺(tái):具有宏轉(zhuǎn)錄組分析云平臺(tái)宏轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容:NR物種注釋、KEGG功能注釋、VFDB功能注釋、CAZy功能注釋、Bacmet功能注釋等基礎(chǔ)功能注釋分析、PCoA分析、物種與功能組成分析(Venn和upset圖、群落Bar和Circos圖、群落Heatmap圖和Bubble圖)、物種與功能差異分析、menteltest分析、物種與功能貢獻(xiàn)度分析、WGCNA分析等內(nèi)容3非靶向代謝組plus200個(gè)26052000儀器:可選用QE-HFX、TOF6600、OE480性能以上的儀器進(jìn)行代謝組檢測二級(jí)譜圖采集:采用正式樣本和QC樣本均采集的模式色譜柱選擇:采用色譜柱C18+色譜柱Amide共同進(jìn)行的模式數(shù)據(jù)庫:標(biāo)準(zhǔn)品自建庫1萬+以上、商業(yè)庫metlin、mzCloud、MassBank、mzvault等、公共庫HMDB、KEGG、Lipidblast、Lipidmaps、GNPS等搜庫軟件:采用ProgenesisQI軟件進(jìn)行搜庫生信分析:可以進(jìn)行差異代謝物分析、VIP值分析、WGCNA分析、時(shí)序分析、GSEA分析、MSEA分析、多因素相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)圖以及機(jī)器學(xué)習(xí)算法的分析宏基因組與代謝組聯(lián)合分析內(nèi)容:普氏分析、O2PLS分析、Manteltest分析、相關(guān)性熱圖分析、線性回歸分析、相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)圖分析、HCLUST分析、MaAsLin分析、WGCNA分析、隨機(jī)森林分析、mmvec分析、通路注釋分析等分析內(nèi)容4真核轉(zhuǎn)錄組測序24個(gè)500120001技術(shù)參數(shù)測序平臺(tái);IlluminaNovaSeq6000;測序方法為PE150;測序深度6G;數(shù)據(jù)質(zhì)量:部分項(xiàng)目要求獲得不低于8G的cleandata,數(shù)據(jù)質(zhì)量Q20>90%,Q30>85%;2服務(wù)內(nèi)容實(shí)驗(yàn)流程服務(wù):包括樣品提取、檢測、文庫構(gòu)建、庫檢、上機(jī)測序等環(huán)節(jié)。生物信息分析服務(wù):轉(zhuǎn)錄本組裝、去冗余、SNP和InDel分析、基因功能數(shù)據(jù)庫注釋、基因定量分析、差異基因表達(dá)分析和功能富集分析等。5廣靶代謝組分析12個(gè)1500180001技術(shù)參數(shù)。儀器平臺(tái):Stellar,ThermoFisher;質(zhì)控:內(nèi)標(biāo)響應(yīng)情況保留時(shí)間控制在12S內(nèi);QC樣品中內(nèi)標(biāo)響應(yīng)穩(wěn)定性,RSD≤20%;批次內(nèi)QC相關(guān)性>08;通過RTQC校正樣本中的RT。檢出數(shù)量:物質(zhì)鑒定數(shù)量5600+。2、服務(wù)內(nèi)容。樣本前處理,上機(jī)檢測,基礎(chǔ)分析,差異分析。6轉(zhuǎn)錄組30個(gè)400120001技術(shù)參數(shù)測序平臺(tái);IlluminaNovaSeq6000;測序方法為PE150;測序深度6G;數(shù)據(jù)質(zhì)量:部分項(xiàng)目要求獲得不低于8G的cleandata,數(shù)據(jù)質(zhì)量Q20>90%,Q30>85%;2服務(wù)內(nèi)容實(shí)驗(yàn)流程服務(wù):包括樣品提取、檢測、文庫構(gòu)建、庫檢、上機(jī)測序等環(huán)節(jié)。生物信息分析服務(wù):轉(zhuǎn)錄本組裝、去冗余、SNP和InDel分析、基因功能數(shù)據(jù)庫注釋、基因定量分析、差異基因表達(dá)分析和功能富集分析等。7代謝組30個(gè)500150001技術(shù)參數(shù)。儀器平臺(tái):OE120,ThermoFisher。質(zhì)控:內(nèi)標(biāo)峰高差在30%內(nèi);QC內(nèi)標(biāo)響應(yīng)RSD<15%;批次內(nèi)QC相關(guān)性>08;通過RTQC校正樣本中的RT。檢出數(shù)量:物質(zhì)檢出總數(shù)5W左右;其中l(wèi)evel1+2+3物質(zhì)鑒定數(shù)量共1500左右;其中l(wèi)evel1平均600左右。2服務(wù)內(nèi)容。樣本前處理,上機(jī)檢測,基礎(chǔ)分析,差異分析。